Vnitřní organizace organismů vychází z informací obsažených v jejich DNA. Kromě informací obsažených v DNA může velikost samotného genomu ovlivnit funkci organismu. Na rozdíl od mnoha jiných skupin organismů je velikost genomu u mykobiontů lišejníků známa jen pro velmi omezený počet druhů. Dosud bylo možné pouze spekulovat, zda existuje souvislost mezi velikostí genomu a ekologií či funkčními vlastnostmi lišejníků. Cílem disertační práce je změřit velikost genomu dostatečného počtu mykobiontů lišejníků, aby bylo možné určit možnou souvislost mezi velikostí genomu a ekologií nebo funkčními vlastnostmi těchto druhů lišejníků.
Úspěšně byla změřena velikost genomu u 50 druhů lišejníků pomocí průtokové cytometrie (FCM). K rozpoznání vlivu fylogeneze na velikost genomu byla provedena molekulární fylogenetická analýza 141 taxonů se známou velikostí genomu. Pro fylogenetickou analýzu byly použity dva geny - ITS a mtSSU. Statistická analýza byla provedena s využitím naměřených velikostí genomů, ekologicky relevantních vlastností lišejníků a fylogenetického stromu.
Bylo zjištěno, že velikost genomu může souviset s preferencí substrátu, vegetativním rozmnožováním nebo typem fotobionta lišejníku. Ve vhodném výběru druhů lišejníků pro srovnání lze nalézt spojení mezi velikostí genomu a životní strategií druhu. Druhy s velkými genomy častěji spadají do kategorie K-stratégů, zatímco druhy s menšími genomy jsou spíše r-strategické.
Možné souvislosti mezi velikostí genomu a ekologií lišejníků
Velikost genomu lišejníků je klíčovým faktorem, který může ovlivnit jejich ekologii a životní strategie. Průtoková cytometrie a molekulární fylogenetická analýza poskytly cenné informace o těchto souvislostech.
Metodika výzkumu
- Měření velikosti genomu u 50 druhů lišejníků pomocí průtokové cytometrie.
- Molekulární fylogenetická analýza 141 taxonů se známou velikostí genomu.
- Použití genů ITS a mtSSU pro fylogenetickou analýzu.
- Statistická analýza zahrnující velikost genomu, ekologické vlastnosti a fylogenetický strom.
Klíčová zjištění
- Možná souvislost mezi velikostí genomu a preferencí substrátu.
- Souvislost mezi velikostí genomu a vegetativním rozmnožováním.
- Vliv typu fotobionta na velikost genomu.
- Spojení mezi velikostí genomu a životní strategií (K- a r-stratégové).
Výsledky naznačují, že velikost genomu není pouze pasivním odrazem evolučních procesů, ale aktivně se podílí na formování ekologických vlastností a životních strategií lišejníků.
Jak efektivně prezentovat závěry své disertační práce: Tipy a strategie | WritersER.com
tags: #jiri #malicek #disertacni #prace