Mikrobiologický ústav Lékařské fakulty Masarykovy univerzity a Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně je společným pracovištěm školským i zdravotnickým.
Obě jeho složky pracují v úzké součinnosti.
Organizačně se ústav člení na úsek klinické mikrobiologie, antibiotické středisko, úsek střevních nákaz, parazitologie a bakteriologie tbc, úsek serologie, úsek virologie, úsek autovakcín, úsek STD a úsek technický.

Výuka a výzkum
Na ústavě probíhá výuka lékařské mikrobiologie pro studenty lékařské fakulty v českém i anglickém jazyce (4. a 5. ročník).
Výzkum se zaměřuje na využití průkazu tvorby biofilmu u mikrobů izolovaných z klinického materiálu, na zhodnocení klinického významu různých faktorů virulence některých bakterií (zejména rod Staphylococcus - hemolyziny, sliz, elastáza) a kvasinek.
Dále pak se ústav orientuje na sérologické metody v diagnostice infekčních nemocí, zejména spirochetových.
K tomu přistupuje srovnávání praktické využitelnosti různých metod k diagnostice běžných patogenů.
Povinnost navštěvovat praktická cvičení je striktně vyžadována, neomluvené absence mohou být důvodem odepření zápočtu.
Povinnost navštěvovat přednášky se nekontroluje, účast je však vřele doporučena vzhledem k tomu, že jsou probírána témata, která jsou málo probrána v literatuře a jsou předmětem zkoušky.
Výuka prvního semestru lékařské mikrobiologie (= čtvrtý semestr studia na LF) je zakončena zápočtem, výuka druhého semestru lékařské mikrobiologie (= pátý semestr studia na LF) je zakončena zápočtem (zde je předpokladem mj. úspěšné napsání zápočtového testu) a rigorózní zkouškou, která se skládá z praktického úkolu a trojice otázek.
Zdravotnický provoz a specializace
Zdravotnický provoz zahrnuje vedle bakteriologické diagnostiky a antibiotického střediska též širokou škálu vyšetření serologických, virologických, mykologických a parazitologických.
Ústav se postupně specializuje v komplexní mikrobiologické diagnostice zejména respiračních nozokomiálních komplikací.
Navazuje tak na transplantační, kardiochirurgický a onkologický program FN.
Komplexně se řeší diagnostika původců pohlavně přenosných chorob včetně virů, chlamydií a mykoplasmat.
Při vyšetření na syfilis lze využít i TPIT (Nelsonův test).
Ústav zajišťuje veškeré mikrobiologické služby pro FN u sv. Anny, Nemocnici Milosrdných bratří, Masarykův onkologický ústav, polikliniku Žerotínovo náměstí (tzv. "Bílý dům") a několik dalších zdravotnických zařízení.

Klíčoví pracovníci a publikace
Mezi významné pracovníky ústavu patří například Doc. MUDr. Vlastimil Obdržálek, CSc., MUDr. Petr Ondrovčík, CSc., prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc., Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D., prof. MUDr. Filip Růžička, Ph.D. a doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
Ústav se podílí na tvorbě odborné literatury.
Základní publikace:
- VOTAVA, Miroslav. Lékařská mikrobiologie obecná. 1. vyd. Brno: Neptun, 2001, 247 s. ISBN 80-902896-2-2.
- Lékařská mikrobiologie. Edited by Ferdinand Přecechtěl. 2. vyd. Brno: Masarykova univerzita-Lékařská fakulta, 1995, 304 s. ISBN 80-210-1087-8.
- VOTAVA, Miroslav a Petr ONDROVČÍK. Vybrané kapitoly z klinické mikrobiologie. 1. vyd. Brno: Masarykova universita, 1998, 90 s. ISBN 80-210-1805-4.
- VOTAVA, Miroslav; Vlastimil OBDRŽÁLEK; Petr ONDROVČÍK; Filip RŮŽIČKA; Ondřej ZAHRADNÍČEK a Vladana WOZNICOVÁ. Lékařská mikrobiologie II. Přehled vyšetřovacích metod v lékařské mikrobiologii. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita. Lékařská fakulta, 2000, 309 s. ISBN 80-210-2272-8.
- VOTAVA, Miroslav; Radomír BUČEK; Vlastimil OBDRŽÁLEK; Petr ONDROVČÍK; Ferdinand PŘECECHTĚL; Viktor RŮŽIČKA; Vladana WOZNICOVÁ a Ondřej ZAHRADNÍČEK. Lékařská mikrobiologie. III. Praktikum - návody k praktickým cvičením, 2. přepracované vydání. Brno: Vydavatelství MU, 2000, 82 s. ISBN 80-210-1309-5.
- Medical microbiology : A guide to microbioal infections: Pathogenesis, immunity, laboratory diagnosis and control. Edited by David Greenwood - Richard C. B. Slack - John F. Peutherer. 16th ed. Edinburgh: Churchill Livingstone, 2002, 709 s. ISBN 0-443-07077-6.
- VOTAVA, Miroslav; Radomír BUČEK; Vlastimil OBDRŽÁLEK; Petr ONDROVČÍK; Ferdinand PŘECECHTĚL a Viktor RUZICKA. Medical microbiology III. Instructions for practical courses - 2nd corrected edition. Brno: Vydavatelství MU, 1995, 93 s. ISBN 80-210-1188-2.
Doplňkové publikace:
- BEDNÁŘ, Marek. Lékařská mikrobiologie : bakteriologie, virologie, parazitologie. 1. vyd. Praha: Marvil, 1996, 558 s.
- GREENWOOD, David. Lékařská mikrobiologie : přehled infekčních onemocnění : patogeneze, imunita, laboratorní diagnostika a epidemiologie. 1. vyd. Praha: Grada Publishing, 1999, 686 s. ISBN 80-7169-365-0.
- MURRAY, Patrick R.; Ken S. ROSENTHAL a George S., et al. KOBAYASHI. Medical microbiology. 4th ed. St. Louis: Mosby, 2002, 826 s. ISBN 0-323-01213-2.
